联邦政府指控苹果反垄断，指苹果对iPhone设下限制，包括选择应用程序、发短信、使用手机行动支付以及无缝使用Garmin或三星智能手表等等，安全性和功能性都受到影响。
尽管苹果曾表示，此类限制可以保护用户安全和隐私。但政府表示，苹果的限制局限用户选择，苹果是在牺牲公众利益，好让自己变得更富有。
iPhone手机用户，应该都有机会体会以下种种限制：
无法发送安全的iMessage给安卓(Android)手机
用iPhone向安卓手机发短信时，各家电话公司都会收到该短信副本，这些短信面对黑客的安全性较差。若将影片短信发给安卓手机友人，他们可能会发现影片被压缩或出现乱码。你也不会收到对方已读短信的显示。使用Windows PC电脑时，也无法像在Mac电脑那样轻松阅读iMessage聊天纪录。
据司法部诉讼，苹果高层2016年向其首席执行官库克(Tim Cook)转发电邮指称，让iPhone和安卓手机用户更易互发短信，「对我们弊大于利」。
iPhone用户无法试用一些可能有用的应用程序
司法部表示，苹果决定在应用程序内封锁此类应用程序，阻止其用户尝试潜在创新产品。几年前，Xbox曾制作类似Candy Crush或「魔兽世界」的iPhone应用程序，但苹果从未让其用户试用。iPhone用户通常必须单独下载各游戏应用程序并付费。
iPhone用户无法使用Apple Pay以外的任何零接触支付服务
iPhone零接触支付技术，保护了手机安全，但苹果限制只能通过Apple Pay服务来进行所有零接触支付，而且每次都会收取费用。用户无法使用PayPal、Cash应用程序、Venmo或其他支付服务来付款。
司法部在诉讼中表示，苹果「行使智能型手机垄断地位」，阻止金融公司为iPhone用户开发更好的支付产品和服务。
欧盟最近通过法律迫使苹果允许其他零接触支付功能。PayPal已告诉它的投资人，它计划在iPhone提供零接触支付功能。